Молекулярно-генетическое исследование генов системы репарации днк у лиц различным онкологическим анамнезом

ВВЕДЕНИЕ 4
ГЛАВА I. ОБЗОР НАУЧНОЙ ЛИТЕРАТУРЫ 6
1.1 Этиология и патогенез РМЖ 6
1.2. Роль системы репарации в формировании РМЖ 10
1.3 Эксцизионная репарация нуклеотидов 11
1.4 Эксцизионная репарация оснований 14
1.5 Гомологичная рекомбинация двунитевых разрывов ДНК 17
1.6 Характеристика и свойства гена XPD1 20
1.6.1 Полиморфные варианты гена XPD1 21
1.7 Характеристика и свойства гена XRCC1 22
1.7.1 Полиморфные варианты гена XRCC1 24
1.8 Характеристика и свойства гена XPG1 25
1.8.1 Полиморфные варианты гена XPG1 26
1.9 Характеристика и свойства гена BRCA2 27
1.9.1 Полиморфные варианты гена BRCA2 29
ГЛАВА II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ 31
2.1. Материалы исследования 31
2.2. Молекулярно-генетические методы 31
2.2.1. Выделение ДНК методом фенольно-хлороформной экстракции 31
2.2.2. Полимеразная цепная реакция и ПДРФ-анализ 32
2.2.3. Электрофорез в полиакриламидном геле 35
2.3. Методы статистической обработки данных 36
2.4. Биоинформатические методы 36
ГЛАВА III. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 38
3.1. Анализ соответствия распределения частот генотипов и аллелей полиморфизма rs13181 гена XPD1 в исследуемых группах распределению Харди-Вайнберга 38
3.2. Анализ соответствия распределения частот генотипов и аллелей полиморфизма rs1799782 гена XRCC1 в исследуемых группах распределению Харди-Вайнберга 39
3.3 Анализ соответствия распределения частот генотипов и аллелей полиморфизма rs34291397 гена XPG1 в исследуемых группах распределению Харди-Вайнберга 41
3.4 Попарный анализ распределения частот генотипов и аллелей полиморфных вариантов генов XPD1 (rs13181), XRCC1 (rs1799782), XPG1 (rs34291397), BRCA2 (rs4987117) у здоровых и в группе с онкопатологией 43
3.5. Анализ сочетаний генотипов полиморфных локусов генов XPD1 (rs13181), XRCC1 (rs1799782), XPG1 (rs34291397), BRCA2 (rs4987117) и исследование роли межгенных взаимодействий у здоровых индивидов и больных с онкопатологией 46
3.5.1. Анализ распределения частот сочетаний генотипов изученных генов у здоровых индивидов и больных c онкопатологией 46
3.6. Биоинформатический анализ 51
3.6.1. Анализ межгенных взаимодействий генов XPD1, XRCC1, XPG1, BRCA2 и метаболических путей белковых продуктов данных генов 51
3.6.2. Анализ изменений физико-химических свойств белковых продуктов генов XPD1, XRCC1, XPG1, BRCA2 под влиянием SNР 52
3.6.3Моделирование пространственных структур белков XPD1,XRCC1, XPG1, BRCA2 56
ГЛАВА IV. МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ 58
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 62
ВЫВОДЫ 64
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 65

Весь текст будет доступен после покупки

Рак молочной железы (РМЖ) на сегодняшний день является наиболее распространенным онкологическим заболеванием среди представительниц женского пола. Не взирая на то, что современные механизмы распознавания и терапии РМЖ имеют существенные успехи, показатель смертности от данного онкозаболевания остаются стабильными и продолжают расти. Скрытое течение болезни и отсутствие явных симптомов на ранней стадии являются основной причиной позднего выявления и, в итоге, смерти пациентов [1].
Разнообразные физико-химических показатели могут оказывать влияние на множество изменений, которые протекают на уровне хранения и передачи генетической информации, соответственно в последовательности генов. Нарушения целостности генома могут инициировать процесс клеточной трансформации, но процессы репарации клеток могут препятствовать этому. Дефекты, связанные с целостностью клеточного генома могут приводить злокачественным трансформациям клетки, но процессы репарации клеток могут его предотвратить [2].
Как показано в исследовании «На сегодняшний день было выявлено множество генов, ответственных за формирование РМЖ. Самой главной причиной, способствующей формированию высокого риска развития данного заболевания, считаются нарушения в генах системы репарации ДНК» [1].

Весь текст будет доступен после покупки

ГЛАВА I. ОБЗОР НАУЧНОЙ ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Этиология и патогенез РМЖ
Каждый год в мире диагностируется примерно 1,7 млн. новых случаев РМЖ (11,6%) (по данным ВОЗ). Заболевание занимает первое место в структуре онкологической заболеваемости женщин. Наивысшие рейтинги заболеваемости отмечены в США, а наименьшие – в странах Европы и России; РМЖ реже встречается в странах Африки и Азии [4]. Самая низкая частота рака молочной железы отмечена в Африке (к югу от Сахары), Юго-Восточной Азии и Японии [5]. РМЖ (21,2%) является основной онкологической патологией среди женского населения в России по данным за 2019 год, а злокачественные новообразования репродуктивной системы в целом имеют наибольший удельный вес среди онкологических заболеваний женщин, составляя 38,8% [6].
Рак молочной железы – злокачественная опухоль, развивающаяся из эпителиальных клеток протоков и паренхимы железы. Молочная железа - гормонозависимый орган, патологические процессы возникают под влияние гормонов [7].
Основная причина развития РМЖ до конца не выявлена, тем не менее, происхождение злокачественной опухоли, вероятно, связана с накоплением генетических аномалий в нормально развивающихся клетках железы. В начале XX века Т. Бовери и К. Х. Бауэр сформулировали мутационную теорию канцерогенеза, согласно которой существует наследственная "склонность тканей образовывать опухоли при определенных внешних условиях". Этот наклон происходит из-за накопления в геноме разнообразных соматических мутаций, которые возникают под воздействием различных физических, химических и биологических факторов окружающей среды и, как правило, становятся причиной неоплазии [4]. Важную роль в развитии рака молочной железы также играют эндогенные факторы, включая стимуляцию клеточного деления на фоне повышенного уровня эстрогенов. Основные факторы риска рака молочной железы включают [8]:
1. Ранний менархе (до 12 лет) и/или поздний возраст менопаузы (после 55 лет).
2. Поздний возраст первых родов (после 30 лет) или их отсутствие.
3. Наличие случаев развития этой злокачественной опухоли в семейном анамнезе (чрезмерно у близких родственников до момента наступления менопаузы).
4. Совокупность сведений о протекании заболевания у пациента.
Все случаи РМЖ можно разделить на спорадические и семейные. К спорадическому РМЖ относятся случаи, характеризующиеся отсутствием заболевания (РМЖ) у родственников первой линии родства. Семейный РМЖ характеризуется наличием заболевания у родственников первой линии родства, диагностированным в возрасте до 40 лет. При этом генетический анализ на BRCA1, BRCA2 отрицательный. При наличии же семейного анамнеза РМЖ и положительным тестом на BRCA1, BRCA2 РМЖ называется наследственным [9]. С каждым годом тенденция развития злокачественных новообразований молочной железы по всему миру неуклонно растет, что ведет к необходимости поиска новых методов по предупреждению, раннему выявлению и диагностике рака молочной железы (РМЖ). В настоящее время, в век молекулярной биологии, особый трепетный интерес в отношении поиска причин развития онкологических заболеваний, вызывает именно изучение молекулярно-генетических свойств опухолевых клеток. Известно, что опухолевые клетки развиваются вследствие неполноценного ответа на повреждение ДНК различными экзогенными и эндогенными факторами. Необходимо отметить, что ответ на повреждение ДНК (DDR, англ. - DNA damage response) является основополагающим процессом в поддержании целостности генома и супрессии опухолевого роста [10].

Весь текст будет доступен после покупки

1. Каипова, А. Ф. Исследование аллельного состояния генов системы репарации (XPD1) и гормонального канцерогенеза (COMT) в норме и при онкопатологии / А. Ф. Каипова // StudNet. – 2022. – Т. 5, № 5. – С. 107. – EDN GFQGQE.
2. Казакова, Т. Ю. Исследование роли полиморфизма генов репарационной системы (XRCC1, OGG1) при онкопатологии / Т. Ю. Казакова // Наука на современном этапе: вопросы, достижения, инновации. Социальное и экономическое развитие в XXI веке. Особенности развития современной науки: актуальные вопросы, открытия и перспективы: Материалы международной научно-практической конференции, Кемерово - Красноярск - Омск, 23–28 декабря 2017 года. – Кемерово - Красноярск - Омск: ИП Шелистов Денис Александрович (Издательский центр "Quantum"), 2017. – С. 236-240. – EDN YPHXBC.
3. Высоцкая И.В. Эндокринно-чувствительные опухоли репродуктивной системы: руководство для врачей. и др. М.: Спец. изд-во мед. кн. (СИМК), 2014. С. 126.
4. Лаптиев, С. А. Молекулярно-генетический "портрет" рака молочной железы / С. А. Лаптиев, М. А. Корженевская, Е. Н. Имянитов // Ученые записки СПбГМУ им. акад. И.П. Павлова. – 2017. – Т. 24, № 2. – С. 12-22. – DOI 10.24884/1607-4181-2017-24-2-12-22. – EDN ZIPGPZ.
5. Семиглазов, В. Ф. Скрининг рака молочной железы [Текст] / В. Ф. Семиглазов, В. В. Семиглазов // Практическая онкология. – 2010. – №2. – С.60-65
6. Каприн, А.Д. Злокачественные образования в России в 2019 году [Текст] / А. Д. Каприн, В. В. Старинский, А. О. Шахзадова и др. // М.: МНИОИ им. П.А. Герцена ? филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России, 2020. – С.4-5.
7. Spugnesi, L. Germline Mutations in DNA Repair Genes May Predict Neoadjuvant Therapy Response in Triple Negative Breast Patients [Text] / L. Spugnes, M. Gabriele, R. Scarpitta et al. // Genes Chromosomes Cancer. – 2016. – V.55. – P.915-924.

Весь текст будет доступен после покупки