Частота полиморфизма гена рецептора витамина D в популяции Казахстана

ПЕРЕЧЕНЬ СОКРАЩЕНИЙ И ОБОЗНАЧЕНИЙ………………….....
ВВЕДЕНИЕ……………………………………………………………....
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ……………………………………...
1.1. Общая характеристика проблемы исследования………………….
1.2. Клинико-физиологические аспекты витамина D…........................
1.3. Рецептор витамина D в аспекте клинической фармакологии……
1.3.1. Структура и функции гена рецептора витамина D……………..
1.3.2. Известные варианты полиморфизмов гена рецептора
витамина D………………………………………………………………
1.3.3. Роль рецептора витамина D и его полиморфизмов в патогенезе различных заболеваний…………………………………………………
1.3.4. Применение витамина D в современной клинической практике......................................................................................................
1.3.5. Исследования эффективности применения витамина D как дополнительного компонента при лечении туберкулеза……………...
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ………….
2.1. Формирование групп исследования………………………………
2.2. Определение полиморфизмов гена VDR………………………………
2.2.1. Выделение геномной ДНК………………………………………
2.2.2. Амплификация (проведение ПЦР)………………………………
2.2.3. Рестрикционный анализ…………………………………………
2.2.4. Разделение продуктов реакции амплификации и рестрикции методом вертикального гель-электрофореза…………………………
2.2.5. Детекция продуктов амплификации……………………………..
2.2.6. Методика определения полиморфизма Cdx2 гена VDR с помощью аллель-специфичной ПЦР…………………………………..
2.3. Методики оценивания состояния пациентов на различных этапах исследования……………………………………………………..
2.3.1. Методики оценивания полученных результатов исследования.
2.4. Статистические методы
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ……
3.1. Исследование распределения генотипов полиморфного локуса rs10735810 гена FokI, у пациентов с туберкулезом легких и здоровых лиц…………………………………………………………….
3.1.1. Анализ ассоциаций полиморфизма гена FokI в различных популяциях……………………………………………………………….
3.2. Изучение распределения генотипов полиморфного маркера BsmI гена VDR, кодирующего рецепторы витамин D, у пациентов с туберкулезом легких и здоровых лиц…………………………………..
3.2.1. Анализ ассоциаций полиморфизма гена BsmI в различных популяциях……………………………………………………………….
3.3. Изучение распределения генотипов полиморфного маркера ApaI гена VDR, кодирующего рецепторы витамин D, у пациентов с туберкулезом легких и здоровых лиц………………………………….
3.4. Изучение распределения генотипов полиморфного маркера TaqI гена VDR, кодирующего рецепторы витамин D, у пациентов с туберкулезом легких и здоровых лиц…………………………………..
3.4.1. Анализ ассоциаций полиморфизма гена TaqI в различных популяциях……………………………………………………………….
3.5. Изучение распределения генотипов полиморфного маркера Cdx2 гена VDR, кодирующего рецепторы витамин D, у пациентов с туберкулезом легких и здоровых лиц…………………………………..
3.6. Результаты рандомизированного двойного слепого плацебо-контролируемого исследования пациентов с ТБ легких на месте демографического наблюдения в Республике Казахстан……………..
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ
ПРИЛОЖЕНИЯ

Весь текст будет доступен после покупки

Актуальность темы диссертации. Туберкулез остается серьезной проблемой общественного здравоохранения и одной из основных причин заболеваемости и смертности во всем мире. По оценкам ВОЗ, ежегодно в мире регистрируется 9-10 миллионов новых случаев заражения туберкулезом легких. Рост заболеваемости, в первую очередь, вызван ухудшением социально-экономического уровня жизни значительной части населения, качества медицинского обслуживания, а также миграцией населения, появлением лиц без определенного места жительства [1].
Витамин D играет не малую роль в борьбе с инфекцией и может быть эффективным средством против туберкулеза. Имеется много исследований, прежде всего, зарубежных авторов, в которых доказывается неблагоприятное воздействие на организм недостаточности витамина D, когда кроме классической его функции - как регулятора фосфорнокальциевого обмена активно исследуются внекостные проявления дефицита витамина D [2, 3, 4].
За последние годы были открыты и собраны убедительные сведения о его роли во многих других биологических процессах, в том числе и в регуляции функций иммунной системы. Рассматриваются перспективы использования препаратов витамина D для профилактики инфекций дыхательных путей (грипп, пневмония, туберкулез), хронического бронхита, подавления избыточного воспаления при инфекции, вызванной респираторно-синцитиальным вирусом (RSV) и вирусом гриппа A (H1N1). В настоящее время активно изучается витамин D и его роль в различных патологических процессах. Витамин D регулирует уровни противовоспалительных цитокинов в ответ на бактериальную инфекцию, кальцитриол снижает активность приобретенного иммунитета и усиливает активность врожденного. Именно поэтому растет интерес к количественной оценке и пониманию механизмов обмена витамина D в организме человека. Распространенность полиморфизма гена рецепторов витамина D (VDR) имеет расово-этнические различия. В одной популяции преобладают одни аллельные варианты, в другой популяции – другие. VDR привлек наше внимание в качестве гена - кандидата в связи с тем, что описан ряд полиморфизмов данного гена, влияющих на опосредованные рецептором эффекты витамина D3 [5, 6].

Весь текст будет доступен после покупки

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Общая характеристика проблемы исследования
По последним оценкам Всемирной организации здравоохранения ежегодно продолжает регистрироваться более 9 млн. новых случаев ТБ и 1,3 млн ежегодно умирает от ТБ [1]. И по этим же данным около одной трети населения мира инфицировано M.tuberculosis, однако меньше чем у 10% из тех, кто инфицирован, разовьется туберкулез [4]. Такая статистика предполагает, что далеко не только бактериальные агенты определяют развитие заболевания. Помимо факторов риска окружающей среды и образа жизни, генетическая предрасположенность также вносит свой существенный вклад [5, 6].
Известно, что витамин D модулирует активность моноцитов и макрофагов в организме и играет важную роль во врожденном иммунитете к некоторым инфекциям, в том числе и к M. tuberculosis. В недавно проведенном мета-анализе было показано, что низкий уровень витамина D коррелирует с высоким риском развития ТБ [7]. Витамин D в большинстве случаев оказывает свое влияние через рецептор витамина D (PBD), ядерный гормональный рецептор. В связи с этим полиморфизм гена VDR может напрямую влиять на активность РВD и изменять низлежащие витамин D-опосредованные процессы, поэтому данные полиморфизмы были определены как потенциальные кандидаты в маркеры риска для различных клинических случаев, связанных с нарушением метаболизма витамина D [8]. Так, в 2005 году Льюис с соавторами провели мета-анализ, в котором оценили корреляцию легочной формы ТБ с наличием полиморфизмов гена VDR FokI (rs2228570) и TaqI (rs731236) [9], а в 2006 году Ян и Хань обобщили известные данные по полиморфизму FokI [6]. Но, к сожалению, ни в одном из указанных исследований не было найдено убедительной взаимосвязи между изученными полиморфизмами гена VDR и легочной формой ТБ. При этом только шесть исследований были обобщены для каждого из полиморфизмов, которые были рассмотрены в двух мета-анализах, эти результаты не обладают необходимой научной мощностью, чтобы обнаружить значимый вклад в исследование механизмов восприимчивости к ТБ того или иного генотипа. Аналогичные работы были проведены и для мутаций ApaI (rs7975232) и BsmI (rs1544410) [10]. Кроме того, небольшое количество включенных исследований также ограничило стратифицированный анализ, чтобы изучить происхождение имеющихся несоответствий. В последние несколько лет все больше исследований было посвящено изучению воздействия полиморфизмов VDR на восприимчивость к ТБ в разных популяциях.

Весь текст будет доступен после покупки

1. World Health Organization. Global tuberculosis report 2020. WHO Report 2020. Geneva: World Health Organization; 2020. Режим доступа: https://www.who.int/publications/i/item/9789240013131
2. Wu, H. Effects of vitamin D supplementation on the outcomes of patients with pulmonary tuberculosis: a systematic review and meta-analysis [Text] / H. Wu, X. Xiong, M. Zhu et al. // BMC Pulmonary Med. – 2018. – T. 18 – P. 108.
3. Junaid, K. Impact of vitamin D on infectious disease-tuberculosis-a review [Text] / K. Junaid, A. Rehman // Clinical Nutrition Experimental – 2019. – P. 1–10.
4. Ganmaa, D. Vitamin D Supplements for Prevention of Tuberculosis Infection and Disease [Text] / D. Ganmaa, U. Buyanjargal, X. Zhou et al. // N Engl J Med. – 2020. – T. 383. – P. 359-368.
5. Huang, S. Vitamin D deficiency and the risk of tuberculosis: a meta-analysis [Text] / S. Huang, X. H. Wang, Z. D. Liu et al. // ORIGINAL RESEARCH – 2016. – T. 11. – P. 91-102.
6. Jaimni, V. Association of Vitamin D Deficiency and Newly Diagnosed Pulmonary Tuberculosis [Text] / V. Jaimni, B-A. Shasty, S. P. Madhyastha et al. // Pulmonary Medicine – 2021. – P. 6.
7. Nnoaham, K. E. Low serum vitamin D levels and tuberculosis: a systematic review and meta-analysis [Text] / K. E. Nnoaham, A. Clarke // Int. J. Epidemiol. – 2008. – Т. 37, № 1. – P. 113-9.
8. Valdivielso, J. M. Vitamin D receptor polymorphisms and diseases [Text] / J. M. Valdivielso, E. Fernandez // Clin. Chim. Acta. – 2006. – Т. 371(1-2). – P. 1-12.
9. Lewis, S. J. Meta-analysis of vitamin D receptor polymorphisms and pulmonary tuberculosis risk [Text] / S. J. Lewis, I. Baker, G. D. Smith // Int. J. Tuberc. Lung Dis. – 2005. - Т. 9, № 10. – P. 1174-1177.

Весь текст будет доступен после покупки