СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ РЕЗУЛЬТАТОВ ХРОМАТО-МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКОГО И МОЛЕКУЛЯРНОГО МЕТОДОВ ИССЛЕДОВАНИЯ МИКРОБИОТЫ СЛЮНЫ ЗДОРОВЫХ ЛИЦ

Перечень сокращений 3
Введение 5
Глава 1. Обзор литературы 9
1.1. Состав и биоразнообразие бактериального сообщества слюны в норме 9
1.2. Изменение композиции и разнообразия микробиоты слюны при болезнях полости рта и системных заболеваниях 11
1.3. Современные аналитические методы идентификации микроорганизмов слюны 14
1.3.1. Бактериологический метод 15
1.3.2. Биохимические методы 18
1.3.3. Молекулярные методы 25
Глава 2. Материалы и методы исследований 36
2.1. Характеристика участников исследования 36
2.2. Метод газовой хроматографии масс-спектрометрии микробных маркеров 37
2.3. Метод идентификации микроорганизмов с помощью ПЦР в реальном времени 38
2.4. Статистические методы исследования 41
Глава 3. Результаты и обсуждение 43
3.1. Структура значимых видов микроорганизмов, формирующих дентальную бляшку, у здоровых женщин репродуктивного возраста 43
3.2. Сравнительный анализ частот встречаемости микроорганизмов слюны, идентифицированных с помощью хроматографического и молекулярного методов 48
Заключение 52
Выводы 57
Список использованных источников 58
Приложение 72

Весь текст будет доступен после покупки

Как сложная экосистема, ротовая полость человека является местом обитания тысяч бактериальных таксонов, взаимодействующих между собой и с другими микроорганизмами (МО). В ней содержится множество различных субниш, такие как слюна, зубные бляшки, десневая борозда и эпителиальные клетки на щеках, языке и зубах [68]. При этом слюна участвует в таких физиологических процессах, как жевание, глотание и речь, она также содержит важные биологические компоненты, включая белки и ферменты, которые необходимы для поддержания гомеостаза полости рта [35]. Слюна играет важную роль как резервуар микроорганизмов из всех экологических ниш в ротовой полости человека. Совокупность микроорганизмов и генетического материала, находящихся в слюне человека, известная как "микробиом слюны", играет ключевую роль в понимании состояния здоровья человека [68].
Микробиота слюны представляет собой сложную и динамичную систему, в которой организм человека и микроорганизмы взаимодействуют и адаптируются друг к другу. Однако при наличии хронического воспаления и оксидативного стресса это взаимодействие может быть нарушено, что может привести к дисбалансу и изменениям в составе микробиома полости рта, что в свою очередь может усугубить воспалительные процессы в полости рта и привести к развитию различных заболеваний [9].
Другими значимыми причинами нарушения структуры сообщества микробиоты слюны могут быть кариесогенные процессы, стоматологические вмешательства, хронические заболевания желудочно-кишечного тракта (ЖКТ), заболевания верхних дыхательных путей, профессиональные риски, связанные с нервно-эмоциональным напряжением и т. д. [9].

Весь текст будет доступен после покупки

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Состав и биоразнообразие бактериального сообщества слюны в норме

Микробиота слюны представляет собой конгломерат бактерий, выделяемых с поверхностей полости рта, основными очагами происхождения которых являются горло, язык и миндалины [35].
Слюна человека содержит разнообразные бактериальные сообщества, отражающие состояние здоровья и особенности питания, способствующие изменчивости сенсорного восприятия пищи. Структура микробиома слюны может быть неоднородной из-за межиндивидуальных различий. Основной микробиом описывается как общая группа микробов, которая важна для биологической функции хозяина, и обеспечивает основу для определения приоритетов представителей, адаптированных к среде обитания хозяина [68].
На состав микроорганизмов слюны могут влиять многие характеристики хозяина, включая возраст, диету, этническую принадлежность, пол, курение, употребление алкоголя, циркадный ритм, индекс массы тела и тип стимуляции [68]. Состав микробиоты слюны в условиях здоровья в некоторой степени определяется также факторами окружающей среды, различается у людей, живущих в разных климатических условиях [35].

Весь текст будет доступен после покупки

1. Бородинов, А. Г. Поколения методов секвенирования ДНК (обзор) / А. Г. Бородинов, В. В. Манойлов, И. В. Заруцкий, А. И. Петров, В. Е. Курочкин. — DOI 10.18358/np-30-4-i320. — Текст : электронный // Научное приборостроение. — 2020. — №4. — С. 3–20. — URL : https://www.elibrary.ru/item.asp?id=44238826 (дата обращения: 26.05.2024). —Режим доступа: Научная электронная библиотека eLIBRARY.RU.
2. Бурмистрова, А. Л. Микробный социум экологической ниши: ротовая полость здоровых детей / А. Л. Бурмистрова, Ю. Ю. Филиппова, Д. Ю. Нохрин, А. В. Тимофеева. — Текст : непосредственный // Инфекция и иммунитет. — 2018. — № Т. 8, № 1. — С. 54–60.
3. Верховцева, Н. В. Метод газовой хроматографии?масс-спектрометрии в изучении микробных сообществ почв агроценоза / Н. В. Верховцева, Г. А. Осипов. — Текст : электронный // Проблемы агрохимии и экологии. — 2008. — № 1. — С. 51–54. — URL : https://www.elibrary.ru/item.asp?id=11749606 (дата обращения: 26.05.2024). — Режим доступа : Научная электронная библиотека eLIBRARY.RU.
4. Давыдова, О. К. Полимеразная цепная реакция: методические указания к лабораторному практикуму по генной инженерии / О. К. Давыдова. — Текст : электронный // ОЭБ Оренбуржья: Открытая электронная библиотека научно—образовательных ресурсов. — 2009. — 148 с. — URL : http://elib.osu.ru/handle/123456789/8887 (дата обращения: 25.05.2024). — Режим доступа : свободный.
5. Дедков, В. Г. Разработка и испытание метода выявления РНК вируса Ласса на основе полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией в режиме реального времени / В. Г. Дедков, М. В. Сафонова, Е. В. Найденова, N. F. Magassouba, А. А. Айгинин, B. Soropogui, F. Kourouma, A. B. Camara, J. Camara, А. А. Крицкий, М. Ю. Щелканов, В. В. Малеев. — Текст: непосредственный // Проблемы особо опасных инфекций. — 2018. — №4. — С. 39-47.
6. Деревенщикова, М. И. Использование молекулярно–генетических методов для микробиологического контроля пищевой продукции / М. И. Деревенщикова, М. Ю. Сыромятников, В. Н. Попов. — DOI 10.21603/2074-9414-2018-4-87-113. — Текст : электронный // Техника и технология пищевых производств. — 2018. — №4. — С. 87–113. — URL : https://www.elibrary.ru/item.asp?id=36932025 (дата обращения: 26.05.2024). —Режим доступа : Научная электронная библиотека eLIBRARY.RU.
7. Землянский, В. А. Использование армированных нуклеиновых кислот в качестве контроля для ПЦР–детекции РНК–вирусов / В. А. Землянский, К. Л. Дедюля, Т. В. Амвросьева. — Текст : непосредственный // Современные проблемы инфекционной болезни человека. — 2014. — № 7. — С. 157–161.
8. Игнатов, С. Г. Разработка и применение современных методов изучения и идентификации микроорганизмов с использованием бионанотехнологических подходов : автореферат диссертации на соискание ученой степени / Игнатов Сергей Георгиевич ; Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии. — Оболенск, 2010. — 47 с. — URL : https://new-disser.ru/_avtoreferats/01005031369.pdf. — Текст: электронный.
9. Ильин, В. К. Сравнение метода ПЦР диагностики и метода масс–спектрометрии микробных маркёров применительно к оценке микробиоты полости рта / В. К. Ильин, З. О. Соловьёва, О. А. Гизингер, А. С. Шеблаева, О. В. Быстрова, С. М. Ловцевич, И. П. Бородин. — Текст : непосредственный // Клиническая лабораторная диагностика. — 2022. — № 67 (8). — С. 484–488.
10. Литусов, Н. В. Бактериоскопические методы исследования : иллюстрированное учебное пособие / Н. В. Литусов. — Екатеринбург : Издательство ГБОУ ВПО УГМУ, 2015. — 55 с. — Текст : непосредственный.
11. Методы исследований в микробиологии: краткий курс лекций для аспирантов направления подготовки 06.06.01 Биологические науки (профиль подготовки — Микробиология) / составители: Л. В. Карпунина, А. А. Щербаков. — Саратов : Издательство ФГБОУ ВПО «Саратовский ГАУ», 2014 — 84 с. — Текст : непосредственный.

Весь текст будет доступен после покупки